Akademi kota dibagi menjadi distriknya sendiri dan sebagian besar dianggap independen. OSIS Umum bertindak sebagai dewan pengurus untuk mengelola akademi secara keseluruhan. Namun, kemampuan kelompok tersebut untuk memerintah telah terhenti sejak hilangnya ketua OSIS secara misterius. Masalah yang tak terhitung jumlahnya mulai muncul di seluruh Kivotos karena tidak adanya kepemimpinan presiden. Untuk menghindari bencana, OSIS Umum meminta bantuan dari Klub Investigasi Federal, atau dikenal sebagai Schale. Faktanya, Schale adalah klub terbaru di kota itu dan yang terakhir disetujui sebelum hilangnya presiden. Untuk menyelesaikan tugasnya, Schale mengandalkan bimbingan seorang Sensei yang dapat membantu mereka menyelesaikan insiden di sekitar Kivotos. (Siswa diharuskan membawa senjata pribadi dan ponsel pintar! Rasakan aksi militer, cinta, dan persahabatan yang ditawarkan Academy City!)
